La Villa de Colima se fundó el 25 de julio de 1523, en un lugar cercano a Caxitlán (en el Municipio de Tecomán).
Su fundador fue el capitán Gonzalo de Sandoval, quien recibió órdenes de Hernán Cortés de buscar un buen sitio y fundar una villa de españoles que debería llamarse Collimán. El Capitán Sandoval localizó este sitio en donde actualmente se encuentra la ciudad de Colima.
Como el lugar donde se fundó la primera villa era malsano, sus pobladores y el ayuntamiento tomaron el acuerdo, en 1525, de trasladarse al sitio actual, consumándose este traslado el 20 de enero de 1527 que corresponde a la fundación de la Villa de San Sebastián de la provincia de Colima. Esta fundación fue la octava realizada por los conquistadores en el territorio de la Nueva España.
Hoy en día es la capital del estado en la que residen los poderes públicos de la entidad, gracias a su privilegiada ubicación geográfica, la capital de Colima cuenta con un clima cálido subhúmedo con lluvias en verano en la mayor parte del municipio; la temperatura media anual es de 24 a 26°C, la vegetación que predomina es la selva baja caducifolia.
El Portal Morelos
El Portal Morelos se llamó primero Portal Brizuela porque Juan de Dios Brizuela mandó su remodelación. Se tienen noticias que en 1789, en este Portal, estaban las casas de las familias más ricas de Colima. En 1906 aquí estuvo el Gran Hotel Europa, llamado después Hotel Casino, hoy Museo Regional de Colima.
El Portal Hidalgo
El Portal Hidalgo, antes llamado Portal Gildardo Gómez, se comenzó a edificar en 1790. Se cuenta que al cura de Colima don Miguel Hidalgo y Costilla en 1792, le gustaba sentarse ahí por las tardes. Este edificio cuenta con 21 arcos lobulados con grandes lámparas coloniales y ha sido objeto de varias intervenciones.
El Portal Medellín
Había un corredor de madera y teja, el Portal Barajas, que un gobernador mandó sustituirlo, hacia 1860: es el nuevo Portal Medellín. Desde entonces ha servido para cantinas, billares, peleterías, peluquerías, hoteles y otros comercios. Portal de gran tradición, utilizado durante muchos años en las ceremonias de las fiestas patrias.
En la esquina del Portal Medellín con la calle Venustiano Carranza, fue asesinado en 1857 don Manuel Álvarez Zamora, primer gobernador de Colima. En su memoria se colocó una placa de bronce que todavía se conserva.